بالاخره با اعلام 197 رأی موافق اعتماد به گزینه دولت، فرهادی توسط علی لاریجانی؛ سوت پایان رقابت مخالفان نفوذ فتنه و اعضای حلقه حاشیه ساز وزارت علوم زده شد. رأی او چندان بالا نبود و تنها از 4 وزیر نزدیک به فتنه حاضر در دولت رأی بیشتری داشت، رأی پایینی که به نظر می رسد بخشی از آن حاصل عدم حضور عمدی برخی نمایندگان بود.
اما آنچه موجب اعتماد به وی بعد از تفاوت نگاه های طولانی مدت مجلس و دولت شد؛ اعلام تبری جدی از فتنه و خط قرمز دانستن آن و نیز غیرواقعی دانستن امضای منسوب به وی در حمایت از موسوی و کروبی بود. " من هیچ نامه‌ای را امضا نکرده‌ام. اگر اسم من هست نمی‌دانم موضوع چی بوده است... فتنه خط قرمز ماست. فصل الخطاب رهبری است."
فرهادی در سخنانش توجهی جدی به موضوع سرعت رشد علمی و نیز تحول در علوم انسانی و دیگر خواسته های رهبری نشان داد. " مسئله محوری امروز دانشگاه پیشرفت علم و دانش است/ تاسیس مرکز رشد علوم انسانی یکی از برنامه‌های بنده است/ برای تاسیس مراکز رشد علوم انسانی و تقویت کرسی‌های آزاد اندیشی برنامه دارم / رشته‌هایی که دیگر بدرد کشور نمی‌خورد باید برداشته و رشته‌های جدید بر اساس نیازهای کشور تاسیس خواهد شد/ در مورد دانشجویان ستاره‌دار با تشکیل کمیته‌ها در چارچوب قوانین و مقررات مسائل را پیگیری می‌کنیم/ مدیرانی را که عالم و متدین و در مسیر نظام و انقلاب باشند انتخاب می‌کنم "
اینک او با شعارهایی رأی آورده است که نیازمند چند اقدامهای جدی همچون بازگرداندن وزارت علوم به مسیر رشد علمی و باور توان داخلی و نیز خلع ید فتنه گران قدرت گرفته دراین وزارت خانه است. انتظار می رود مجلس در آینده با دقت روند رفتاری وی را بررسی کرده و در صورت عدم وفای به عهدی که امروز بسته شد، بدون مماشات برخورد نماید.
اما نکته جالب دیگر در جلسه رأی اعتماد امروز رفتار مضحک علی مطهری بود که اعلام کرد به دلیل موافقت مجلس مخالف سخن خواهد گفت. سخنان او نشان داد راز عملکرد غیرمنتظره او در سالهای اخیر چیست. هویدا شد که مطهری راه یافه به مجلس از فهرست رایحه خوش خدمت چرا امروز چنین مواضعی دارد. گویا او "مخالفت" را راز دیده شدن دانسته است.
