به گزارش نما، یکی از جنجالی‌ترین موضوعات مطرح شده، در دولت تدبیر و امید، مسئله بورسیه‌های غیرقانونی بود. چنان‌که اولین بار مجتبی صدیقی معاون وزیر علوم و رئیس سازمان امور دانشجویان ۴ خرداد ۱۳۹۳ در یک نشست خبری مدعی تخلف بیش از ۳۰۰۰ دانشجوی بورسیه شد. یک سال پس از اتهام وارده و پس از بررسی‌هایی که توسط کمیسیون اصل نودمجلس شورای اسلامی صورت گرفت رئیس کمیسیون اصل نودطی نامه‌ای به وزارت علوم بصورت رسمی اعلام کرد که بجز ۳۶ مورد که مندرجات خود را خلاف واقع درج نموده‌اند، سایر بورسیه‌های اعطاء شده قانونی و طبق روال بورسیه می‌باشد. اما واکنش‌ها و سخنان اطرافیان جریان حامی دولت و اصلاحات همچنان بر ادعا خویش پافشاری کردند. اما در این میان موضع مقام معظم رهبری در دیدار بیش از هزار نفر از استادان و اعضای هیأتهای علمی دانشگاههای سراسر کشور، آنکه قابل تأمل بود. ایشان علاوه برآنکه، سیاسی بازی را سم محیط‌های علمی خواندند، با ابراز تأسف از اینکه در موضوع بورسیه ها به خیلی‌ها ظلم شد، بیان داشتند: سیاسی کاری به کار اصلی دانشگاه‌ها یعنی تلاش و پیشرفت علمی ضربه می‌زند. چنانچه فرودند:«یکی از غلط ترین کارهایی که در این یکی دو سال اخیر اتفاق افتاد، این مسئله بورسیه‌ها بود که در این ماجرا به خیلی‌ها ظلم شد و این کار هم خلاف قانون بود و هم خلاف تدبیر.»
اما بعد از گذشت دوسال ازاین موضوع هنوز اما و اگرهای را در گوشه و کنارها برخی از اظهارنظر به چشم می‌خورد. از طرفی قوه قضائیه برای استیفای حق دانشجویان موظف شده تا به این موضوع رسیدگی کند.
زاهدی؛ طرح بحث بورسیه‌ها فی‌النفسه اشکالی ندارد ولی نباید در فضاسازی ناجوانمردانه دنبال شود
کوچکی‌نژاد؛ طرح اعلام تخلف بورسیه‌ها؛ یک حرکت کاملا سیاسی بود/
به علت ضعف عملکرد وزیراین پرونده در مسیر خود دچار مشکلاتی شد
وی افزود: اما بعد سخن رهبرمعظم انقلاب،انتظار این بود که وزارت علوم این پرونده را سریعا ببندد؛ متأسفانه به علت ضعف عملکرد وزیراین پرونده در مسیر خود همچنان دچار مشکلاتی شد. و از طرفی متأسفانه قوه قضائیه هم به خوبی ورود پیدا نکرد. حداقل انتظار داشتیم دیوان محاسبات و یا سازمان بازرسی دستگاه‌های نظارتی به این مسئله ورود پیدا کنند و ماجرا را ختم بکنند و آنجایی را که تخلف شده پیگیری کنید.
کوچکی‌نژاد خاطر نشان کرد: حال اینکه عده‌ای بخواهند با دستاویز قرار دادن این موضوع و با بهانه‌تراشی، بورسیه‌ها را دوباره مطرح بکنند؛ این احتمال وجود دارد که با هماهنگی نیروهایی در داخل وزارتخانه بخواهند بر طبل این ادعا بکوبند و با شانتاژ خبری و رسانه‌ای چند صباحی افراد به خود مشغول کنند.
وی یادآوری کرد: معتقدم اگر عده‌ای بخواهند با افراط و تفریط با طرح مباحثی در جامعه ایجاد اختلاف کنند و یا حقوق عده‌ای را ضایع نمایند، مسلما مجلس دهم، مجلس مقتدری است و در جهت دفاع از حقوق مردم ورود خواهد کرد و نمی‌گذاریم، این عده با مطالب حاشیه‌ای، مجلس را معطل بکنند. لذا اگر هنوز در رابطه با بورسیه‌ها مطالب خاصی مطرح است باید بگذاریم که این موضوع مسیر قانونی خودش را طی کند.
