به گزارش نما، آقای عطاءالله مهاجرانی در پاسخ به سوال یکی از کاربران سایت شخصی خود درمورد مقام معظم رهبری، اظهار داشت: «بی تردید ایشان شایسته ترین شخص برای رهبری کشور ما در این دوران بسیار حساس و مهم هستند.»
وزیر فرهنگ و ارشاد دولت اصلاحات، مطلبی را با عنوان "طبیعت مرگ" در وب سایت خود منتشر کرده و در ذیل آن با این پرسش مواجه شده است: «در مورد رهبری آقای خامنه ای نظر روشن شما چیه؟ تا چه اندازه قبول دارید رهبری ایشون رو؟» وی در پاسخ می نویسد: «رهبری ایشان را کاملا قبول دارم. بی تردید ایشان شایسته ترین شخص برای رهبری کشور ما در این دوران بسیار حساس و مهم هستند.»
مهاجرانی ضمن بیان اینکه البته من نسبت به شیوه رهبری ایشان در انتخابات 88 منتقد هم هستم، می افزاید: «شیوه رهبری ایشان در انتخابات اخیر و پس از آن، تحسین برانگیز بوده است.»
گفتنی است، آقای مهاجرانی پیشتر و طی سخنانی در کتابخانه کنزینگتون لندن، 2 تفاوت عمده ایران و مصر را این گونه مورد تاکید قرار داده بود: «اول، استقلال بی نظیر ایران و عدم هرگونه وابستگی در برابر وابستگی مصر به آمریکا و دوم، عدم فساد اقتصادی آیت الله خامنه ای در برابر فساد مبارک و خانواده اش. خود من که از آغاز انقلاب در مجلس بودم و در دولت بودم و آیت الله خامنه ای را می شناسم به عنوان منتقد ایشان اقرار می کنم که یک نقطه خاکستری حتی -نه تاریک- در زندگی اقتصادی ایشان و خاندانشان نمی شود پیدا کرد.»